墨西哥《经济学家报》2月5日报道，根据墨西哥参议院特别委员会对地铁12号线的调查，项目总投资达到470亿比索（1美元约合14.5比索），高于墨西哥城至克雷塔罗高铁项目预计投资额（450亿比索）。
墨西哥城12号地铁项目仅有26公里，超过半数的地铁站无法使用。目前已经支付226.7亿比索，另外还需要支付15.88亿美元用于机车服务，按合同规定的1美元合16.27的汇率，合258.39亿比索。此外，确认存在的问题另需6270万比索，维修投资1886万比索。
西班牙CAF公司否认存在费用高估，该项目以提供服务（PPS）的方式进行，私人企业负责设计、建设和15年运营维护，合同包括提供机车和配套服务，15年融资和维护，墨城政府当地无力购买机车，因此通过PPS的方式，服务提供商负责提供融资。PPS方式涉及到融资成本、保险和维护成本、人员培训、厂房设备等费用。