穗深不可能实现地铁直达，但将来可实现无缝换乘
从轨道办相关负责人了解到，因为轨道制式、客流组织方式和运营管理模式不统一，以及地铁车辆不具备长距离运营条件，深圳和广州之间不可能实现地铁直达。但根据珠三角轨道交通规划建设方案，深圳、东莞和广州之间的城市地铁网络可以实现无缝换乘，深圳市民可以不出站换乘坐地铁到达广州。
据了解，深圳轨道交通11号线和6号线将与东莞轨道交通R3线、R1线实现轨网衔接。深圳地铁11号线起自福田站，止于松岗碧头站，预留向北延伸在长安海悦花园或长安步行街与东莞地铁R3线衔接。深圳地铁6号线起自深圳北站，止于松岗站，规划在荔林站与东莞地铁R1线衔接。另外，深圳地铁16号线规划穿越东莞凤岗站，初步计划在东莞境内设站3座。而东莞地铁规划建设时也做好了与广州地铁衔接的准备。
穗莞深城际线与地铁可互相换乘
从轨道办相关负责人表示：“除了地铁线路衔接外，穗莞深三座城市之间目前已经有广深铁路和广深港高铁两条城际铁路，现在穗莞深城际线还在建设中，城际轨道无缝连接城市地铁，可以满足三座城市之间的频繁的客流出行需求。”
根据珠三角城际铁路规划，广深和谐号可以在深圳站、布吉站、东莞站、石龙站、广州东站和广州站与城市地铁网衔接，广深港高铁则在深圳北站、虎门站和广州南站与城市地铁衔接。