合肥高铁南站交通枢纽打造“零换乘”理念，各种交通换乘无缝对接，为了更方便旅客换乘，合肥客运公司通过前期的旅客问卷调查及试运行，于2016年1月24日正式开通高铁快线。
目前，高铁快线共有2条路线：一号线从高铁南站出发，途径包河万达、明光路汽车站、元一希尔顿(新亚汽车站)、合肥站(客运总站)、双岗、北城世纪城；二号线从高铁南站出发，途径客运南站、明珠广场、天鹅湖大酒店、皇冠假日酒店、十里庙、客运西站。根据合肥市物价局的规定，高铁快线的票价为：15元/位。运行时间与高铁南站列车运行时间同步，适时发车。
旅客到达高铁南站后，从到达大厅西出口走到合肥南站候机厅即可购票乘坐高铁快线。同时，高铁南站机场候机厅机场快线运营时间为6:40——19:10，每天20班次，平均约40分钟一班车。